Програмне забезпечення Incucyte

Програмне забезпечення для візуалізації та аналізу живих клітин

Програмне забезпечення Incucyte® спрощує процес отримання, перегляду, аналізу та обміну зображеннями живих клітин, як ніколи раніше. Дозволяє дослідницьким командам перетворювати зображення на аналітичні матеріали за допомогою спеціально розроблених інструментів аналізу базового програмного забезпечення та комплексних програмних модулів, що забезпечують потужний фенотипічний клітинний аналіз.

Програмне забезпечення для аналізу базових даних Incucyte®

Програмне забезпечення Incucyte® Base Analysis спрощує складний процес, але водночас забезпечує потужний робочий процес, який підтримує всю вашу дослідницьку команду.

Інтерфейс з інструкціями та спеціально розроблені інструменти роблять процес отримання, перегляду, аналізу та обміну зображеннями живих клітин простішим, ніж будь-коли раніше, за допомогою класичного або нового аналізу на основі штучного інтелекту.

Робочий процес базового програмного забезпечення Incucyte®

Робочий процес аналізу конфлюенції Incucyte® AI

Аналіз конфлюентності на основі штучного інтелекту забезпечує простий робочий процес для високоточної сегментації клітин на фазово-контрастних зображеннях, адаптуючись до широкого спектру типів клітин та морфологій з мінімальним втручанням користувача. Аналіз конфлюентності на основі штучного інтелекту доступний з програмним забезпеченням Incucyte® версії 2022A або новішої.

Робочий процес аналізу конфлюентності Incucyte® Classic

Класичний аналіз конфлюентності дозволяє налаштувати параметри фазової сегментації до окремих типів клітин та експериментальних умов, щоб точно розрізняти фонові та позитивно флуоресцентні об'єкти в широкому діапазоні інтенсивності, а також, залежно від оптичного модуля, дозволяє кількісно визначити зелені, помаранчеві, червоні та/або ближні інфрачервоні флуоресцентні об'єкти на кожному зображенні.

Огляд базового програмного забезпечення Incucyte®

Отримання зображень

Інтерфейс Incucyte® Acquisition допомагає користувачам налаштувати експериментальні параметри, використовуючи вибрані мікропланшети, колби та чашки. Просто виберіть параметри та натисніть «Пуск» для надійного та безперервного отримання зображень живих клітин.

Перегляд

Incucyte® VesselView дозволяє користувачам навігувати та досліджувати тисячі зображень уповільненої зйомки з безпрецедентною ефективністю. Переглядаючи зображення всіх місць у вашому експерименті одночасно, ви можете швидко оцінити ефекти лікування або виявити викиди. Ви також можете накладати метрики для швидкої оцінки та перевірки параметрів обробки зображень. Потім створюйте готові для презентації зображення та відео лише кількома клацаннями миші.
Легко переглядайте зображення всіх місць в експерименті одночасно, щоб сканувати тенденції та викиди, а потім збільшуйте масштаб лунок, що цікавлять.

Аналіз

Інтерфейс Incucyte® Analysis дозволяє навіть новачкам перетворювати зображення на аналітичні дані. Завдяки спеціально розробленим інструментам для відповідей на ваші наукові запитання, обробка та аналіз зображень є нескладними, але надзвичайно потужними. Створюйте визначення аналізу один раз, а потім повторно застосовуйте їх до наступних експериментів, щоб генерувати показники в режимі реального часу, які дозволяють приймати рішення. Легко переглядайте всі тенденції в експерименті одночасно за допомогою графіків мікропланшетів Incucyte® та створюйте налаштовані криві відгуку, готові до публікації та презентації.

Інтерфейс керованого аналізу дозволяє навіть користувачам-початківцям перетворювати зображення на аналітичні дані, використовуючи потужну сегментацію на основі штучного інтелекту або класичну сегментацію для вимірювання конфлюентності.
Інструменти побудови графіків дозволяють переглядати тенденції та швидко створювати графіки, готові до публікації та презентації.

Рекомендовані програмні модулі Incucyte®

Програмний модуль аналізу класифікації 3D-об'єктів Incucyte® (кат. № BA-04907)

Програмний модуль аналізу класифікації 3D-об'єктів Incucyte® представляє новий рівень аналітичних можливостей для 3D-досліджень клітинних культур. Цей модуль дозволяє дослідникам автоматично ідентифікувати та класифікувати популяції сфероїдів, органоїдів та інших складних 3D-біологічних структур на основі ключових морфологічних та функціональних характеристик, включаючи форму, розмір та інтенсивність флуоресценції.

Програмний модуль аналізу виявлення ядер Incucyte® AI (кат. № BA-04897)

Пришвидшіть свої дослідження на основі зображень за допомогою програмного модуля Incucyte® AI Nuclei Detection Software Module — рішення на базі штучного інтелекту для сегментації прикріплених ядер клітин без міток з HD-фазово-контрастних зображень. Цей спеціально розроблений інструмент використовує попередньо навчену модель глибокого навчання для забезпечення високоточної детекції ядра без необхідності використання флуоресцентних міток, барвників або ручної сегментації.Цей модуль підтримує широкий спектр застосувань, включаючи аналіз проліферації клітин без міток, пряме кількісне визначення флуоресценції ядра для досліджень клітинного циклу та цитотоксичності, а також виявлення змін у морфології ядра, викликаних сполуками, таких як набухання ядра. Сумісний з усіма системами Incucyte®, цей модуль спрощує та стандартизує неінвазивний аналіз клітин завдяки оптимізованому робочому процесу, що дозволяє дослідникам об'єктивно аналізувати здоров'я та проліферацію клітин у різних експериментальних установках. Програмне забезпечення Incucyte® AI Nuclei Detection Software доступне для придбання для всіх приладів Incucyte® CX3 та S-Series та вимагає версії програмного забезпечення 2025B або вище.

Програмний модуль Incucyte® для аналізу органоїдів (кат. № 9600-0034)

Програмний модуль Incucyte® Organoid Analysis дозволяє автоматизований збір даних та аналіз органоїдів без міток протягом усього робочого процесу.

• Характеризуйте диференціацію та дозрівання культур органоїдів, вбудованих у Matrigel®, у 24- або 48-лункових планшетах.
• НОВИНКА! Відтворюйте форму органоїдів та оцінюйте вплив обробки на життєздатність в одному планшеті за допомогою 96-лункових планшетів Incucyte® 3D Nanowell (потрібне програмне забезпечення версії 2024A або пізнішої), які містять надрукований гідрогелем масив мікролунок для високопродуктивного скринінгу сполук.
• Модуль доступний для систем аналізу живих клітин Incucyte® SX5, S3, SX1.

Програмний модуль аналізу здоров'я клітин Incucyte® AI (кат. № BA-04871)

Аналіз клітин за допомогою штучного інтелекту (ШІ) пропонує спрощені рішення для ваших дослідницьких проектів. Спростіть складність класифікації живих та мертвих клітин за допомогою аналізу зображень на основі штучного інтелекту (ШІ) – без потреби в мітках. Програмне забезпечення для аналізу здоров'я клітин Incucyte® AI забезпечує потужний робочий процес, який підтримує всю вашу дослідницьку команду.
Програмний модуль аналізу здоров'я клітин Incucyte® AI доступний для придбання для всіх приладів серії S та вимагає встановлення співпроцесора GPU (BA-04870) як додаткового оновлення апаратного забезпечення до контролера та програмного забезпечення версії 2022B. У цьому програмному модулі доступна додаткова класифікація популяцій клітин на основі параметрів без міток або флуоресценції .

Програмний модуль Incucyte® 21 CFR, частина 11 (кат. № BA-04876)

 Програмний модуль Incucyte® 21 CFR Part 11  пропонує комплексні функції безпеки та електронного ведення обліку. Його можна придбати для всіх приладів серії S та для нього потрібна версія програмного забезпечення 2023A або вище.

Додаткові програмні модулі Incucyte®

Програмний модуль Incucyte® Advanced Label-Free Classification Analysis (кат. № BA-04867)

Об'єктивно контролюйте зміни морфології прикріплених клітин, щоб визначити кількість живих/мертвих клітин або класифікувати клітини на основі морфології за допомогою багатовимірного аналізу без міток. Для модуля потрібен програмний модуль Incucyte® Cell-By-Cell Analysis Software Module (кат. № 9600-0031) або програмний модуль аналізу здоров'я клітин за допомогою штучного інтелекту (кат. № BA-04871).

Доповнення Incucyte® Advanced Label-Free Classification Analysis для Incucyte® Cell-by-Cell Analysis або AI cell Health Analysis дозволяє автоматизовано ідентифікувати зміни морфології клітин за допомогою інтегрованого отримання зображень без міток, сегментації та багатовимірного аналізу форми клітин. Відстежуйте біологічні зміни за допомогою неупереджених, інтелектуальних значень за замовчуванням, що відкриває нові можливості для порівняння результатів тестів в різних експериментах для:

• Автоматичної класифікації клітин без міток на основі морфології
• Виконання неупередженого аналізу морфології клітин
• Проведення фенотипового скринінгу без міток
• Аналізу морфологічних змін без міток у субпопуляціях живих або мертвих клітин

Робочий процес аналізу класифікації без міток Incucyte® Advanced Label-Free показує кроки, необхідні для проведення аналізу живих/мертвих клітин без міток. Зображення автоматично отримуються та сегментуються за допомогою програмних модулів Incucyte® Cell-by-Cell Analysis або AI cell Health Analysis. За допомогою доповнення Incucyte® Advanced Label-Free Classification отримують морфологічні ознаки та навчають класифікатор, використовуючи контрольні лунки з живими та мертвими клітинами. Потім цей класифікатор застосовується до всіх лунок та точок часу для отримання кількості та відсотка клітин класу А та відсотка клітин класу В на зображення.

Програмний модуль аналізу АТP Incucyte® (кат. № 9600-0033)

Аналізуйте динаміку АТФ, захоплюючи флуоресцентні зображення, одночасно якісно відстежуючи пов'язані зміни морфології клітин у кожній лунці 96- або 384-лункового планшета. Модуль доступний лише для системи аналізу живих клітин Incucyte® SX5, налаштованої з оптичним модулем метаболізму SX5.

Аналіз АТP Incucyte® – це комплексне рішення, що складається з приладів, програмного забезпечення та реагентів, що дозволяє проводити прямий аналіз АТP, що сприяє розумінню метаболічних змін у ракових клітинах. Оцінюйте метаболічні зміни, як ніколи раніше!

Ракові клітини демонструють метаболічну перебудову, що підтримує підвищені темпи проліферації та виживання в мікросередовищі пухлини. Це явище визнано ознакою раку. Нещодавні дослідження також вказують на важливість розуміння складних взаємозв'язків між раковими клітинами та стромальними клітинами, пов'язаними з раком, зокрема оцінки того, як метаболічний симбіоз сприяє стійкості до ліків. Дослідники використовують широкий спектр біологічних методів, щоб розширити свої знання про метаболічні зміни, пов'язані з раком, та для розробки протипухлинної терапії. Однак оцінка метаболічних змін у складних моделях ракових клітин, коли вони проліферують та взаємодіють з навколишнім середовищем, обмежена сучасними методами.
Традиційні методи вимірювання метаболічних змін часто:

• Не можуть розрізнити специфічні для типу клітин метаболічні зміни в складних моделях спільного культивування
• Використовують непрямі, побічні вимірювання метаболізму, на відміну від прямого вимірювання виходу метаболічного АТФ
• Не інтегрують підтвердження морфології клітин
• Аналізують кінцеву точку, а не виконують кінетичну оцінку
• Не враховують фізіологічно релевантні умови навколишнього середовища, тим самим створюючи потенційні артефакти

Програмний модуль аналізу подряпин Incucyte® (кат. № 9600-0012)

Програмний модуль Incucyte® для вимірювання міграції та/або інвазії клітин в аналізах подряпин на ранах.

Обробляйте зображення 96-лункового аналізу Incucyte® Scratch Wound Assay для аналізу міграції та інвазії клітин без міток та флуоресценції.

Інтегрований алгоритм аналізу автоматично маскує кожне зображення, щоб визначити положення пошкоджених (без клітин) та неуражених (заповнених клітинами) зон, щоб забезпечити надійні вимірювання ширини рани, злиття ран та відносної щільності рани (RWD) протягом усього періоду експерименту.

Програмний модуль Incucyte® для аналізу ангіогенезу (кат. № 9600-0011)

Програмний модуль Incucyte® для вимірювання динаміки судинних трубок.

Визначте та проаналізуйте формування та порушення ендотеліальних судинних мереж з часом у кожній лунці 96-лункового планшета. Розроблено для роботи з Incucyte® 96-well PrimeKit, моделлю спільного культивування ендотеліальних/стромальних клітин, для вимірювання довжини мережі, точок розгалуження, площі та показників однорідності ширини протягом усього експерименту.

Сегментація флуоресцентного зображення формування судинних трубочок за допомогою Incucyte® в експерименті зі спільним культивуванням PrimeKit HUVEC та фібробластів шкіри людини. Зображення є поєднанням справжнього флуоресцентного зображення (зелений колір) та накладеної маски (білий колір). Червоні лінії ілюструють виміряні трубочки.

Програмний модуль для аналізу сфероїдів Incucyte® (кат. № 9600-0019)

Аналізуйте ріст, життєздатність та інвазію окремих сфероїдів у круглодонних, багатолункових планшетах або вимірюйте багатосфероїди у плоскодонних планшетах, щоб виявити зміни в рості та життєздатності всередині вашого інкубатора для культури тканин.

Програмний модуль для аналізу сфероїдів Incucyte® дозволяє здійснювати кінетичне отримання даних та об'єктивну оцінку сфероїдів у фізіологічно відповідному середовищі. Разом із системою аналізу живих клітин Incucyte® CX3, що включає конфокальний аналіз з обертовим диском, дослідники отримують чіткі кінетичні 3D-зображення сфероїдів з мінімальним порушенням умов культивування, що забезпечує більш насичений та послідовний аналіз з часом. Для широкопольної флуоресцентної та світлопольної візуалізації це програмне забезпечення повністю сумісне з системами Incucyte® SX1, S3 та SX5.

Інтеграція оптимізованих протоколів та програмного забезпечення Incucyte® дозволяє стандартизувати весь робочий процес зі сфероїдами, від генерації, маніпуляції та аналізу, використовуючи вимірювання на основі зображень, без міток або флуоресценції. Характеризуйте та оцінюйте ріст або інвазію та морфологію сфероїдів під час культивування та досліджуйте вплив обробок шляхом неупередженої оцінки розміру, кількості та морфології. Спеціально розроблене програмне забезпечення Incucyte® автоматично контролює та кількісно визначає зміни у двох різних моделях аналізів, залежно від вашого наукового питання.

Програмний модуль для аналізу хемотаксису Incucyte® (кат. № 9600-0015)

Додатковий програмний модуль для системи аналізу живих клітин Incucyte®.

Аналізуйте міграцію або інвазію хемотаксичних клітин без міток та з флуоресцентним міченням, одночасно якісно контролюючи морфологію кожної клітини в кожній лунці 96-лункових планшетів Incucyte® Clearview.

Програмний модуль аналізу Incucyte® Neurotrack (кат. № 9600-0010)

Програмний модуль Incucyte® для вимірювання динаміки нейритів.

Програмний модуль Incucyte® Neurotrack дозволяє користувачам автоматично обробляти зображення Incucyte® та аналізувати динаміку нейритів з мітками або без них у живих клітинах у кожній лунці 96- або 384-лункових планшетів. Алгоритм маскує та кількісно визначає кожне зображення та повертає показники нейронних клітин, включаючи довжину нейритів, точки розгалуження, площу тіла клітини та кількість кластерів клітин. Ці показники візуалізуються у вигляді графіків повного циклу для кожної лунки в 96- та 384-лункових планшетах. Аналізи можна проводити безпосередньо на фазово-контрастних зображеннях, що усуває необхідність використання міток клітин в експериментах з монокультурою, або на флуоресцентних зображеннях з використанням непертурбуючих зондів, які можуть знадобитися в реагентах для моделей систем спільного культивування.

Автоматизована сегментація фазово-контрастних зображень нейритів (жовтий) та кластерів тіла клітини (синій) у нейронах кори щурів за допомогою програмного модуля аналізу Incucyte® Neurotrack та системи аналізу живих клітин Incucyte® Live-Cell.

Програмний модуль Incucyte® для вимірювання динаміки нейритів

Програмний модуль аналізу нейронної активності Incucyte® (кат. № 9600-0032)

Аналізуйте активність та зв'язність нейронних мереж, фіксуючи короткочасну кінетику протягом тривалих періодів часу, одночасно якісно контролюючи морфологію клітин у кожній лунці 96-лункового планшета. Модуль доступний для систем аналізу живих клітин Incucyte®, налаштованих з оптичним модулем Green/Orange/NIR або Orange/NIR.

Програмний модуль Incucyte® для поклітинного аналізу (кат. № 9600-0031)

Програмний модуль Incucyte® для поклітинного аналізу дозволяє використовувати низку застосувань для змішаних культур адгезивних та неадгезивних клітин. Виконуйте підрахунок клітин без міток на адгезивних та неадгезивних клітинах та подальшу класифікацію клітин за формою, розміром або інтенсивністю флуоресценції для кількісної оцінки динамічних змін у субпопуляціях у змішаній культурі, відкриваючи новий світ відкриттів.

Ідентифікація, класифікація та аналіз підмножин клітин легко виконується за допомогою набору спеціально розроблених програмних інструментів та керованого робочого процесу.

Програмний модуль Incucyte® Advanced Label-free Classification Analysis Software Module (кат. № BA-04867) – це додатковий модуль до модуля поклітинного аналізу, який дозволяє ідентифікувати клітини без міток з морфологією, що цікавить.